〇始まりの街
ティラノししょうに会う。
〇レックスホール
ボスのティラノししょうを倒す。
ボス：ティラノししょう
〇始まりの街
ティラノししょうに会う。
〇カプラーホール/シスアドホール/ミムドホール
ボスのブラッドナイツコマンダーを倒す｡
ボス：ファントモン､バケモン､デビドラモン
ボス：デスメラモン､メラモン､フレアリザモン
ボス：パンプモン､キウイモン､ウッドモン
〇ギップスホール
何も見えないのでとりあえず帰還しよう。
〇デバイスドーム
ドランドナに話しかける。
〇ギップスホール
ボスのブラッドナイツコマンダーを倒しジジモンを救出する。
ボス：ズドモン､イッカクモン､トータモン
〇始まりの街
ジジモンハウスでジジモンと話す。その後もう一度話しかけると新しい情報が手に入る。
街の外に出ようとするとイベントが起こるので、再びジジモンハウスへ行きエスティーナに会う。
〇ノイズホール
ボスのベルトラン(8F)､リンリンシャオ(8F)､アークシュルツ(11F)､ヴィーヴィー(11F)､クロンガンダー(11F)､トノサマゲコモン(14F)､カオスピエモン(15F)を倒す。
ボス：デジタマモン､オオクワモン､イガモン
ボス：もんざえモン､デラモン､スターモン
ボス：ホーリーエンジェモン､エンジェウーモン､ガルダモン
ボス：リリモン､ピッコロモン､ブロッサモン
ボス：ヴァンデモン､ファントモン､ベーダモン
ボス：トノサマゲコモン､ゲコモン×2
ボス：カオスピエモン､ギロモン､アンドロモン
〇リバーブホール/バイアスホール
ボスのカオスグレイモン､カオスシードラモンを倒す｡
ボス：カオスグレイモン､トリケラモン､アノマロカリモン
ボス：カオスシードラモン､メガドラモン､ギガドラモン
〇始まりの街
ジジモンと話す｡
〇クラスタホール
ボスのクリムゾンとカオスロードを倒す｡
ボス：ヴェノムヴァンデモン､ヴァンデモン､パンプモン
ボス：カオスロード
〇始まりの街
ジジモンと話す｡
※ディレクトリ大陸編（後半）へ
〇デジタルシティ
リーダールームのリーダーと話す。
〇バグバグホール
ボスのブラッドナイツコマンダー×3(7F)(11F)(15F)とダメダボース(17F)を倒す。
ボス：ズドモン､ヒョーガモン､アイスモン
ボス：バードラモン､デスメラモン､ブルーメラモン
ボス：アトラーカブテリモン､トゲモン､ウッドモン
ボス：グランクワガーモン､ガーベモン､エクスティラノモン
〇スプールホール
ボスのブラッドナイツコマンダー×2(7F)(12F)とダメダボース(17F)を倒す。
ボス：ピエモン､ムゲンドラモン､デジタマモン
ボス：メタルティラノモン､ボルトモン､ガードロモン
ボス：エテモン､ワルもんざえモン､ガーベモン
〇デジタルシティ/デバイスドーム
メインゲート→コロシアム→テイマークラブの順に行きダメダボースを捕まえる｡
その後デバイスドームに行き、デジタルシティのリーダールームへ行く。
〇フリーズホール
ボスのクリムゾンを倒す。
ボス：ネオクリムゾン
〇デジタルシティ
コロシアムでランク9をクリアして､リーダーと話す｡
〇シャトルポート
シャトルでカーネルゾーンへ。
〇コアタワー
ボスのしゅごしゃを倒す。(最初に選んだガードチームによってボスが変化する)
ボス：ぎんのしゅごしゃ(ワクチン)orあおのしゅごしゃ(データ)orくろのしゅごしゃ(ウィルス)
〇カオスタワー
？？？？？(GAIA)を倒す。その後？？？？？(GAIA)第2形態(本体、右手、左手)を倒す。
エンディングへ！